Generiranje konsenzusnog slijeda iz grafova djelomično uređenih višestrukih poravnanja

Sažetak na hrvatskom: Za razliku od uobičajenih metoda dobivanja konsenzusa (koja mogu prikazati akcije supstitucije i dodavanja/brisanja), koristeći usmjerene grafove moguće je prikazati složenije promjene u evoluciji slijeda, kao što su translacija domene, duplikacija i rekombinacija. Implementaci...

Full description

Permalink: http://skupnikatalog.nsk.hr/Record/fer.KOHA-OAI-FER:46122/Details
Glavni autor: Baćac, Adriano (-)
Ostali autori: Šikić, Mile (Thesis advisor)
Vrsta građe: Drugo
Impresum: Zagreb, A. Baćac, 2015.
Predmet:
LEADER 02338na a2200241 4500
003 HR-ZaFER
005 20160531113713.0
008 160221s2015 ci ||||| m||| 00| 0 hr d
035 |a (HR-ZaFER)ferid1876 
040 |a HR-ZaFER  |b hrv  |c HR-ZaFER  |e ppiak 
100 1 |a Baćac, Adriano  |9 36783 
245 1 0 |a Generiranje konsenzusnog slijeda iz grafova djelomično uređenih višestrukih poravnanja :  |b završni rad /  |c Adriano Baćac ; [mentor Mile Šikić]. 
246 1 |a Generating consensus sequence using partially ordered multiple sequence alignment graphs  |i Naslov na engleskom:  
260 |a Zagreb,  |b A. Baćac,  |c 2015. 
300 |a 29 str. ;  |c 30 cm +  |e CD-ROM 
502 |b preddiplomski studij  |c Fakultet elektrotehnike i računarstva u Zagrebu  |g smjer: Računarska znanost, šifra smjera: 41, datum predaje: 2015-06-12, datum završetka: 2015-07-13 
520 3 |a Sažetak na hrvatskom: Za razliku od uobičajenih metoda dobivanja konsenzusa (koja mogu prikazati akcije supstitucije i dodavanja/brisanja), koristeći usmjerene grafove moguće je prikazati složenije promjene u evoluciji slijeda, kao što su translacija domene, duplikacija i rekombinacija. Implementacija ovog rada nudi mogućnost stvaranja više konsenzusnih sljedova iz grafova djelomično uređenih višestrukih poravnanja koristeći format zapisa programskog alata POA. Stvoreni konsenzusi nisu ograničeni na lokalne promjene zbog veće mogućnosti prikaza informacija pomoću usmjerenih grafova.  
520 3 |a Sažetak na engleskom: Unlike conventional methods of obtaining consensus (which can only display changes like substitution and addition / deletion), the use of partial order multiple sequence alignment graphs allows more complex changes in the sequence evolution, such as translation of a domain , duplication and recombination. Implementation shown in this work offers the possibility to create multiple consensus sequences from graphs using the file format of the programming tool POA. The resulting consensuses are not limited to local changes, due to greater level of information stored in graphs used to represent multiple sequence alignment. 
653 1 |a usmjereni graf  |a višestruko poravnanje  |a POA  |a konsenzus 
653 1 |a ordered graph  |a multiple aligment  |a POA  |a consensus 
700 1 |a Šikić, Mile  |4 ths  |9 29535 
942 |c Z  |2 udc 
999 |c 46122  |d 46122